Синоптофор застосовується з діагностичними та лікувальними цілями: за його допомогою можна визначити величину суб'єктивного та об'єктивного кутів косоокості, здатність до біфовеального злиття зображень, наявність фузійних резервів та величину функціональної скотоми.
З лікувальною метою синоптофор застосовується для усунення функціональної скотоми, розвитку біфовеального злиття зображень, фузійних резервів та рухливості очей.
Для визначення кута косоокості за допомогою синоптофора користуються об'єктами на суміщення.
Після включення приладу (одночасно двох об'єктів) дитині пропонується встановити труби синоптофора так, щоб малюнки поєдналися, наприклад так, щоб машинка
"в'їхала" у гараж.
Для цього дитина може або сама переміщати окуляри приладу, або стежити за переміщенням об'єктів лікарем (медичною сестрою) та повідомляти про їхнє поєднання.